Primer sequences
Exon/Fragment | Sequence | Product size (bp) |
---|---|---|
1/1 | 5′-TTGGGCCTTGCGGCTGTC-3′/5′-CCCTCCGTTGAGGTTCTTCG-3′ | 347 |
1/2 | 5′-GCTGAGTGATGCCAACAAGGC-3′/5′-CAAGCGCCCCGCCGCTATG-3′ | 267 |
2 | 5′-TAATGCCAGAAGACTTGGAAT-3′/5′-AAAAAGTCTGCCTGTCTGTC-3′ | 377 |
3 | 5′-ACCCGGCCCTTATTGTTTAT-3′/5′-CTTCCCCCATCACCCTAA-3′ | 260 |
4/1 | 5′-TATTGTAGCTTGGGCGTAGC-3′/5′-ACCATTCTCTTCCGCTTTCG-3′ | 554 |
4/2 | 5′-GTGGGGGATAGTGAGAGTG-3′/5′-ATTTCCCCACCTTGTAACAG-3′ | 451 |
4/3 | 5′-CCTGATCACCCCGATTTTGA-3′/5′-TCCCTCCTCACCACTCTAT-3′ | 380 |
4/4 | 5′-GCATTTGGCCGTTATTCAGA-3′/5′-TGTACTGGGGGATAGTGTG-3′ | 386 |
4/5 | 5′-TCAGATGATCGCCATTGTTC-3′/5′-AGAGGCCCAATTCACTTTTC-3′ | 325 |
4/6 | 5′-TGGCATTGGGGTGATGTTAC-3′/5′-TGGCATTGGGGTGATGTTAC-3′ | 373 |
4/7 | 5′-AGAGAGGGTTGATACTTGCC-3′/5′-ACTTCTTCCATGATCCCTATAA-3′ | 357 |
4/8 | 5′-GCAGGGCTATAATGTATGAAG-3′/5′-TCTGTTGCGCTGTTTCTCTA-3′ | 365 |
4/9 | 5′-AGCAGGCTTTGACTCTGATT-3′/5′-CCAACACTGCGATACACTCT-3′ | 383 |
4/10 | 5′-ATTTGCCAGAAGAATACGAGT-3′/5′-CTGGCAAACAGCACTACTTAT-3′ | 262 |
5 | 5′-TGAAGCCTCACTTTTACCCT-3′/5′-GTCACTGGCTGACTTTTATGT-3′ | 406 |
6 | 5′-TAAGGGTTCATAAGAAAGACAA-3′/5′-TTAAAGGCTCATATACAAGAAG-3′ | 283 |
7 | 5′-GCAAAATGAGTATTCATTTGTG-3′/5′-CTTCAAATGAGAAGTTTAATGTC-3′ | 399 |
8 | 5′-TTGTGGCACAGACCGATAG-3′/5′-CAGAAGTGCCCTCTCAAAAA-3′ | 577 |
9 | 5′-TGAGAGGGCACTTCTGTTG-3′/5′-TCCCTTCCCCTTTTACTGTT-3′ | 328 |
10 | 5′-AAGGGATGATGCACTATGAAAA-3′/5′-TAAAACAGCCTGAAAGTGTATG-3′ | 369 |
For RT-PCR | 5′-AGAATGCTTTTAGACGTGGAT-3′/5′-GCTATTGCCGTCCCATCAAAT-3′ | |
Northern-blot probe | 5′-GCATTTGGCCGTTATTCAGA-3′/5′-ACTTCTTCCATGATCCCTATAA-3′ |